Les musées de Céphalonie aideront les visiteurs à mieux comprendre l'histoire de l'île.

Le musée historique et folklorique se trouve dans la bibliothèque Korgialenios d'Argostoli. Dans ce musée, les visiteurs en apprendront plus sur la tradition, la vie folklorique et la civilisation urbaine et rurale depuis la période de domination vénitienne jusqu’à 1953. L'exposition comprend des documents historiques, portraits, collections d'objets personnels, personnages historiques, ustensiles de la vie cotidienne, cartes et dessins de monuments historiques, photographies historiques et œuvres d’art religieuse.

Le Musée d'Histoire Naturelle, avec sa riche collection d'expositions sur la flore et la faune, est pour les visiteurs une excellente façon de se familiariser avec l'environnement naturel de l'île.

Enfin, le musée de l’Environnement situé dans l'ancienne école primaire de Fiscardo présente une exposition unique des "trésors" naturels et sous-marins de Céphalonie.